Тустань – унікальна пам’ятка, а тому навіть саму методику графічної реконструкції дерев‘яної наскельної забудови Михайлові Рожку довелося розробляти самотужки. Вивчення міста-фортеці починалося з дослідження бібліотек та архівів у 1971 р., і продовжилося фотографіями, рисунками та архітектурними обмірами слідів на скелях у 1971-1978 рр., та численними експедиціями і археологічними розкопками у 1978-1989 рр.
У 1982 р. з ініціативи Михайла Рожка було створено Карпатську архітектурно-археологічну експедицію Академії наук України, і це дозволило значно детальніше вивчити Карпатську лінію оборони Х-ХІІІ ст.
Сучасна Тустань теж є центром наукових досліджень. Тут вивчають дерев’яну наскельну архітектуру, давні технології будівництва, петрогліфи, системи водозабезпечення, обороноздатності та зброю Тустані, архіви Михайла Рожка. Продовжують археологічні дослідження, етнографічні експедиції, проводять історичні реконструкції та експерименти (Карпатська сигналізація, випробування середньовічної каменеметної машини). Але також застосовують сучасні технології: за допомогою фотограмметрії та лазерного сканування було створено тривимірну модель скельних комплексів із забудовою, а також мобільний додаток доповненої реальності, який дозволяє кожному побачити давню фортецю наче живу.